身为《移动迷宫》三部曲的导演Wes Ball这么描述三部影片在场景设定上的差异：“第一部影片，我们看到的是一个腐朽的水泥迷宫。第二部影片，我们看到的是一片荒芜的沙漠。而在《移动迷宫3：死亡解药》里，我们会看到一个玻璃和钢铁组成的世界。每一部电影发生的地点，都有自己的风格和色调。”当主角一行向WCKD组织宣战之后，这个由玻璃和钢铁组成的世界就成为了他们的目标，然而迷宫行者们甚至不确定这个地方到底存不存在。

　　
“原著一直到第三本才出现了一个对抗WCKD的抵抗组织，而我的想法是，为什么我们不让这个组织提前登场呢？”在第二部影片的结尾就让双方处于剑拔弩张的临战状态，这也稍稍偏离了原著中的设定，导演Wes Ball对于自己能获得足够空间，在创意方向上做出修改感到非常感激。“电影中的一些东西和书里并不完全一样，但这些内容是受到原著启发而创作的，我们很荣幸能够邀请原著作者James Dashner 加盟，审核这些内容以及我们做出的决定。我们希望能尽自己所能，做到既尊重原著的粉丝，又能让他们看到想看的内容。”
　　
James Dashner 也确认了这一点：“原著的粉丝们都非常忠于剧情，也极力保护这些剧情，但有一些内容改动之后更加适合在电影宇宙中展现。韦斯·波尔找到这些点，我认为原著粉也会喜欢这些改动。”